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内在途径哺乳动物的内在途径,也称为线粒体介导的凋亡途径,在细胞外和细胞内应激(例如辐照,细胞毒性药物和氧化应激)上被激活。响应于该信号,Bcl-2家族蛋白Bax和Bak的p53依赖性激活被插入线粒体膜中,从而使细胞色素C从线粒体中释放出来。同时抑制了抗凋亡Bcl-2家族蛋白Bcl-2和Bcl-XL。细胞色素C的释放是形成一个称为凋亡组的结构的关键事件,该结构包括APAF-1(70R-49373和70R-15757),Procaspase-9和细胞色素c。细胞色素C促进APAF-1蛋白的七聚体,从而与procaspase-9结合以形成凋亡小体。仅激活procaspase-9才能下游caspase起作用,例如caspase 3。出于这个原因,procaspase-9称为引发剂caspase,而下游则称为效应子caspase。这些效应子胱天蛋白酶进行了细胞的降解。在哺乳动物中,凋亡蛋白抑制剂(IAP)可以抑制内在途径中的胱天蛋白酶的激活,这是当表达SMAC/Diablo等IAP拮抗剂时产生的。Bcl-2和IAP都调节哺乳动物的内在途径。

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