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本文档描述了使用Illumina技术请求库排序时要遵循的过程。本指南中提供了准备工作,图书馆提交,运输要求以及任何其他信息的详细说明。要避免请求处理的任何延迟,必须仔细遵循本指南中提供的说明。请注意,库的处理延迟将根据项目的大小而有所不同。建议与客户管理办公室联系以获取有关处理时间的信息。本指南中提到的要求还适用于图书馆质量控制项目。绘制流动池上群集边界并进行基本调用的Illumina软件取决于末端的序列复杂性,尤其是在插入的任一端,尤其是第一个十二左右的碱基对。因此,必须正确识别在这些区域中表现出足够序列复杂性的任何类型的库,否则测序数据将不足以最佳。这包括但不限于:•扩增子•BD狂想曲单细胞库•减少了基因组表示方法,例如限制性与位点相关的DNA(RAD)标记库•具有较低核苷酸复杂性(如双硫酸盐)的库中的库。为了通过低复杂性库克服此问题,可以在车道的10-50%处将控制库(例如,由Illumina提供的控制PHIX174库)升入,具体取决于初始库的复杂性。将PHIX添加到车道中将导致感兴趣的库的读数较低。上述相同的核苷酸复杂性问题适用于多路复用库时的索引序列。为了获得最佳结果,在多路复用库时,每条车道应至少使用3个索引。将按原样提供测序结果。CES对与库的设计,质量或序列复杂性有关的问题负责。

序列准备库Illumina Technology

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