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多个组件部分的长DNA序列的一锅组装是现代合成生物学构建的迅速产生的关键。的一锅组装方法的方法是由短悬垂链接的多个片段(例如金门)取决于准确和公正的连接。迄今为止的连接设计很大程度上取决于使用经验法则和经验成功的使用,而不是有关连接酶保真度和偏见的详细数据。在这项研究中,我们应用了太平洋生物科学单分子实时测序技术来直接测量单个实验中每个可能的5'基础悬垂配对的连接频率。使用IIS类型限制酶BSAI,已应用此综合数据集来预测金门组装(GGA)的准确性。基于连接数据设计的十个片段组件,其连接数据预计会导致高或低的保真度组件。实验结果不仅证实了总体准确性,还确认了观察到的特定不匹配连接误差及其相对频率。数据进一步用于设计LAC操纵子的12-或24-片段组件,这些组件被证明以高忠诚度和效率组装。因此,连接酶保真度数据允许预测高准确的悬垂对套件的设计比经验法则更大的灵活性,即使在定义的编码区域内,也可以在没有天然DNA序列修改的情况下,在高准确的连接点上安装> 20个片段。

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