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肽是化学和生物学中相关的分子实体,其应用从药物发现[1,2]到食品技术[3,4]。机器学习已加速了肽发现,例如,用于从头设计,序列优化和证明/生物活性预测[5-8]。机器学习的关键步骤是肽的反应[9,10],从而将相关的结构插入转换为用于模型训练的数值格式。可以采用几种策略来编码肽信息,例如,通过描述物理化学特征[10],单速编码[11]和/或进化信息[12]。这些方法中的每一种都捕获了不同的结构信息,可能适合不同的机器学习方法[13],并且可能对模型性能有唯一的贡献[11,14]。虽然公共批准可用于特定编码meth-

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