机构名称：
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蛋白质通过化学相互作用介导其功能；建模通常是通过侧链的这些相互作用是蛋白质设计中的重要需求。但是，构建全原子生成模型需要适当的方案来管理结构和序列中编码的蛋白质的共同连续和离散性质。我们描述了蛋白质结构Protpardelle的全部原子扩散模型，该模型立即将所有侧链状态表示为“叠加”状态；定义蛋白质的叠加叠加在样品产生过程中的单个残基类型和构象中。与序列设计方法结合使用时，我们的模型能够编码全原子蛋白质结构和序列。生成的蛋白质在典型的质量，多样性和新颖性指标下具有良好的质量，而Sidechains则重现了天然蛋白质的化学特征和行为。最后，我们探讨了模型以无主链和无旋转器方式进行全原子蛋白设计和脚手架功能基序的潜力。
全原子蛋白生成模型
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