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背景：微生物社区活动提供了有关了解细菌群落的重要信息。不幸的是，它们通常不直接观察到。我们依靠纵向丰富的概况来了解微生物社区活动。通常没有足够的纵向采样点来成功应用我们的算法。因此，在本文中，我们有兴趣分析从类似环境的多个数据集以减轻上述问题。此外，我们希望看看集体模式识别是否会增强我们对微生物社区活动的理解。结果：在本文中，我们提出了COPR，这是集体微生物纵向丰度数据的框架。我们的可视化表明，不存在时间丰度变化的单一模式。但是，这也表明即使是完整的个性也不存在。因此，我们的可视化突出了类似主机环境的丰度谱的时间变化中的个性和顺从性。我们还确定了TVAP中的不同特征（丰度轮廓的时间变化）模式在凝聚力和分离方面。结论：COPR通过可视化工具有助于获得对微生物群落及其异质性的基本见解。本文还强调了微生物社区数据分析中个性与合规性之间的选择。
copr：集体模式识别 - 微生物社区活动分析的框架
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