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在过去的几十年中，我目睹了计算机科学技能在健康和生命科学方面的职业发展的越来越重要。但是，并非每个人都有学习计算机编程的技能，倾向或时间。学习过程通常很耗时，并且需要持续的实践，因为软件框架和编程语言会随着时间的推移而变化。这是撰写本书的主要动机，内容涉及使用壳牌脚本来解决常见的健康数据以及文本处理任务。shell脚本的优点是：i）如今几乎所有个人计算机都可以使用； ii）几乎不变了四十年； iii）相对容易学习，作为一系列独立的编写； iv）解决健康和生活专业人员面临的许多数据问题的增量和直接方法。在过去的几十年中，我很高兴为健康和生命科学的本科生教授介绍性计算机科学课。我使用程序和语言（例如Perl和Python）来解决数据和文本处理任务，但是我总是感到失去了大量时间教导这些语言的技术，这可能会随着时间的流逝而改变，并且对大多数学生不打算追求高级BioIntormatics课程的学生无关紧要。因此，本书的目的是激励和帮助专家在短暂的学习期后自动化常见的数据和文本处理任务。如果他们变得有兴趣（我希望有些人这样做），这本书将指示他们可以获得更先进的计算机科学技能。这本书并不是要成为壳脚本命令的全面汇编，而是对健康和生活专家的入门指南。本书介绍了命令，因为它们需要自动化数据和文本处理任务。鉴于我的研究经验及其与健康和生活研究的相关性，所选任务非常关注文本挖掘和生物医学本体。然而，本书中介绍的相同类型的解决方案也适用于许多其他研究领域和数据源。
健康与生命科学的数据和文本处理
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