没有血缘。产前超声图显示脉络丛增大和双侧心室肿瘤。胎儿核型在羊膜穿刺术上是正常的46 XY。出生体重为1620 g(<10世纪),长度为42厘米(<10摄氏度),头圆周为31.5 cm(第10倍)。出生时的身体发现很小,妊娠年龄出现新生儿,畸形相,前fontanelle的扩大,层状褶皱,高拱形的口感,五个手指的中间角度浮肿(单个折痕)(单折痕),腺体下孢子虫(图1),腺体肌扰动和佩里氏固定。超声心动图是正常的。腹部超声检查在胆总管囊肿的胆囊附近显示出一个囊肿(3x3 mm)(图2)。神经显影图(生命日#1)显示左侧心室的室系室室室脑室外密度,在两个侧脑室中有多个分隔(图3A,3B)。头部的MRI(生命日#31)露出左侧室室
在法国,标准的妊娠监测安排了在妊娠早期医学咨询时进行 21 三体综合征(唐氏综合征)产前筛查的选项,该筛查基于多种因素(主要是母体血清标志物 (MSM)、母亲年龄和胎儿颈部透明带的超声测量)的评估。自 2018 年起,当联合筛查确定的风险在 1/1,000 至 1/51 之间时,已提供基于循环无细胞 DNA 检测的无创产前检测 (NIPT)。在这种情况下,或者在多胎妊娠、有 T21 妊娠史或父母携带涉及 21 号染色体的罗伯逊易位(2018 年 12 月 14 日法令规定的条件)的情况下,法国国民健康保险系统将全额承担检测费用。仅当妊娠早期联合筛查显示风险为 1/50 或更高,或 cfDNA 检测结果为 T21 阳性时,才进行为诊断目的(特别是通过核型分析)进行的侵入性测试(羊膜穿刺术或绒毛膜绒毛取样)。
摘要背景:HAP1 是一种近单倍体人类白血病癌细胞系,常与 CRISPR-Cas9 基因编辑技术结合用于基因筛选。HAP1 携带费城染色体 (Ph) 和插入 19 号染色体的额外的约 30 Mb 的 15 号染色体片段。体外细胞系作为生物医学研究模型系统的潜在用途取决于其维持基因组稳定性的能力。作为一种具有近单倍体基因组的癌细胞系,HAP1 容易出现遗传不稳定性,而其在培养中自发二倍化的倾向进一步加剧了这一问题。此外,CRISPR-Cas9 基因编辑加上长时间的体外细胞培养可能会诱发意外的“脱靶”细胞遗传学突变。为了深入了解染色体不稳定性 (CIN) 和核型异质性,使用多重荧光原位杂交 (M-FISH) 在单细胞分辨率下对 19 个 HAP1 细胞系进行了细胞遗传学表征,其中 17 个为近单倍体,两个为双单倍体。我们重点研究了新的数值 (N) 和结构 (S) CIN,并讨论了观察到的不稳定性的潜在致病因素。对于每个细胞系,我们检查了其倍性、基因编辑状态和体外细胞培养时间。结果:19 个细胞系中有 16 个已经过基因编辑,传代次数从 10 到 35 不等。17 个近单倍体细胞系的二倍体化范围为 4% 到 35%,[1n] 和 [2n] 中期的 N- 和 S-CIN 百分比范围为 7% 到 50%,两个细胞系没有显示 CIN。两种双单倍体细胞系中患有 CIN 的细胞百分比分别为 96% 和 100%。观察到的最常见的 S-CIN 是缺失,随后是非相互易位和罗伯逊易位。有趣的是,我们观察到近单倍体和双单倍体细胞系中都普遍存在与 13 号染色体相关的 S-CIN,且涉及 13 号染色体的罗伯逊易位发生率很高。此外,基因座特异性 BAC(细菌人工染色体)FISH 使我们首次能够显示额外的 15 号染色体片段插入到 HAP1 基因组 19 号染色体的 p 臂而不是 q 臂中。结论:我们的研究揭示了 CIN 的高发生率,导致大多数 HAP1 细胞系的核型异质性,并且细胞系之间的染色体畸变数量有所不同。值得注意的观察是与 13 号染色体相关的结构染色体畸变频率很高。我们表明,CRISPR-Cas9 基因编辑技术与自发二倍体化和长期体外细胞培养相结合,可能有助于在现有 CIN 的 HAP1 细胞系中诱导进一步的染色体重排。
行为(图1 b),它们对碱性磷酸酶活性呈阳性(图1 c)。我们确定了八个培养通道后通过RT-PCR清除载体和外源重编程因子基因(图1 D)。还通过RT-PCR评估了多能相关转录因子Oct4,Sox2,Klf4,Nanog,Cripto和Rex1的内源性表达(图1 e)。免疫荧光分析表明,转录因子Oct4,Nanog,Sox2和表面标记物SSEA3,SSEA4,TRA1-60和TRA1-81多能ES细胞的特征(图1 f)。多能相关基因,Oct4和Nanog的启动子,在原始纤维细胞中重大甲基化的N44SV.5线几乎被脱甲基,这表明表观遗传重编程至多能性(图1 g)。IPSC系列已适应了无馈物培养条件,并在二十多个培养通道后显示出正常的核型(46,XY)(图1 h)。我们还通过DNA填充分析来确认,N44SV.5是源自原始细胞的(图1 I)。最后,使用基于胚胎的身体在体外测试了生成的IPSC线分化为三个胚芽层(内膜,中胚层和外胚层)的能力(图
对非异常胎儿的基因组测序已经开始,支持者认为它可以帮助人们获取更广泛的相关结果并提高怀孕期间的自主权。3目前,国际产前诊断协会建议向所有孕妇提供核型和微阵列检查,而外显子组测序应该只用于胎儿异常的病例。4然而,一些患者开始询问这项技术在看似健康的怀孕中的用途似乎只是时间问题。在实践中,使用基因组测序检测超声异常的胎儿和筛查看似健康的胎儿之间的界限已经变得模糊。常染色体显性遗传病的无细胞胎儿 DNA 筛查已经在市场上销售,并正在向那些寻求尽可能多信息的孕妇推销。 5 接受超声异常胎儿外显子组测序的患者可能会得到与影像学结果不完全对应的结果,并且与出生后才能确诊的疾病有关。此外,由于胎儿外显子组测序提供了一种超越产前诊断并评估当前美国医学遗传学学会 (ACMG) 发现列表中的基因的选择,因此成人发病的胎儿疾病已经受到质疑。因此,关于胎儿外显子组测序作用的问题变得迫在眉睫。现在是解决两个并行问题的时候了:
许多牲畜物种的高维基因组信息的获取正在加速。这不仅得益于基因分型成本的不断降低,还得益于利用基因组信息创造更高投资回报的可用服务的扩展。单个动物的基因组信息有许多用途,包括 (1) 亲子鉴定和发现、(2) 可追溯性、(3) 核型分析、(4) 性别决定、(5) 报告和监测导致重大影响或先天缺陷的突变、(6) 更好地评估个体的近亲繁殖和个体之间的共同祖先、(7) 交配建议、(8) 确定品种组成、(9) 实现精准管理,以及 (10) 基因组评估;基因组评估利用全基因组的基因型信息来提高预测动物(以及其后代)遗传价值的准确性。基因组数据也为研究提供了巨大的资源,尽管这项研究的成果如果成功,最终应该通过前面提到的十个应用之一来实现。本文描述了从样本采购到识别错误基因型的整个基因型生成过程,以及在开发用于实际应用的定制基因分型面板时应考虑的步骤。2023 作者。由 Elsevier BV 代表动物联盟出版。这是一篇根据 CC BY 许可证开放获取的文章(http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
GATA2表达是一种复杂的多系统疾病,患有骨髓增生综合征(MDS)和急性髓样白血病(AML)具有高风险,并且寿命几乎完全完整。1,2 GATA2载体表现出高度可变的表达性,一些人在早期发作MD中发育,而其他人则在整个生命中仍然无症状。尽管不存在预后生物标志物,但合作遗传和表观遗传驱动因素可能会塑造疾病的进程。3尽管在一组白血病驱动基因(即Stag2,setBP1,ASXL1和ETV6)中鉴定出复发的体细胞突变的进展,但了解GATA22携带者中与白血病相关的molecu Lar机制存在重大差距。4此外,DNA甲基化改变有助于在成人PA和AML的成年PA含量中发生白血病克隆和异常高甲基化的启动和扩展。5,6迄今为止,尚未进行GATA2患者的基因组宽DNA甲基分析。在这项研究中,招募了7家西班牙医院的20个临床注释的GATA2载体(表1;在线SUP培养图S1)。诊断时中位年龄为36(范围6-75)。主要初始表现为MDS(n = 12,55%),其次是免疫效率(n = 3,15%)和AML(n = 2,10%)。在细胞遗传学上,三个患者中的三体术在两个患者中进行了复杂的核型,而有11例患者的核型正常(在线补充图S1A-F)。基于DNA的可用性,因此在17 GATA2载体的总外周血(Pb)或骨髓(BM)中进行了乳酸突变。因此,在71%(12/17)测试的患者中鉴定了髓样恶性基因中的乳酸突变(在线补充图S1F)。该分析证实了GATA2缺乏效率中获得的体细胞突变的异质性,stag2,asxl1和setBP1作为经常影响的基因。,我们获得了通过使用矿体内甲基化史诗850 K平台(Illumina)进行完全遗传表征的患者的全球DNA甲基化pro纤维。我们为八个BM(P1,P3,P5,P6,P10,P11,P11,P12,P13)和八个PB样品(P1,P1,P4,P7,P7,P8,P9,P9,P13,P13,P16和P17)的LED DNA进行了比较,并与12(5 pb和7 BM)的队列进行了比较(5 pb和7 bm)老年人(Hefleped Donor)(hded donor)(高维数据可视化表明,GATA2患者的射击性紧密聚集在一起,并从HD隔离。属于同一家族的无症状载体P1,P1,P16和P17(分别为6、40和75岁)被包含在HD组上(图1A)。此外,我们将HD与无症状
该梅奥诊所机构审查委员会的书面知情同意书后,生成患者特定的IPSC - 批准的研究(09-006465),IPSC是从4个诊断为LQTS的4个无关患者的外周血单核细胞中产生的;每个在KCNQ1中都有不同的LQTS促性致病变体(c.760g。a,p.v254m),kcnh2(c.1810g。a,p.g604s)或scn5a(c.3965c。t,P.P1332L和C.4868G。A,P.R1623Q)。使用细胞收益2.0 sendai重编程试剂盒(Thermo Fisher Scientifuc,MA; MA; A16517)通过sendai病毒转导重编程,通过仙台病毒转导编程。在感染后21天内采摘10个菌落,并在克隆上扩展以进行进一步分析。crispr(定期间隔短的短质体重复序列)/cas9基因编辑/变体校正,等源性对照(IC)IPSC线是由Applied Stemcell(Milpitas,CA)设计的。所有IPSC克隆均被确定以表达TRA-1-60,SSEA-3,OCT4和Nanog多能标记,并具有正常的核型。通过sanger测序确定了患者衍生的IPSC线中的杂合致病变异和IC线中特定变体对野生型的遗传校正。
†最后一位联合作者摘要Emery-Dreifuss肌肉营养不良1型(EDMD1)是由EMD基因突变引起的罕见遗传疾病,该突变编码编码核包膜蛋白Emerin。尽管了解了疾病的遗传基础,但肌肉和心脏发病机理的分子机制仍然难以捉摸。进展受患者衍生样品的可用性有限的限制,因此迫切需要人类特异性的细胞模型。在这项研究中,我们介绍了诱导多能干细胞(IPSC)系的产生和表征,这些细胞(IPSC)系来自携带EMD突变的EDMD1患者,这些突变导致EMD突变,这些突变与健康供体的IPSC一起导致截断或缺失。患者特异性的IPSC表现出稳定的核型,保持适当的形态,表达多能标记,并证明将分化成三个细菌层的能力。为模型EDMD1,这些IPSC被分化为肌源性祖细胞,成肌细胞和多核肌管,这些肌管代表了肌发生的所有阶段。每个发育阶段都通过特定于阶段的标记的存在来验证,从而确保模型的准确性。我们提出了第一个基于IPSC的体外平台,该平台捕获了肌发生过程中EDMD1发病机理的复杂性。该模型可以显着有助于理解疾病机制,并为EDMD1制定靶向的治疗策略。
尽管赖氨酸甲基转移酶2a(KMT2A)基因重排,代表急性髓样白血病(AML)中常见的致癌事件,但KMT2A扩增的频率较小,并且与独特的临床和遗传特征相关。我们对三名与KMT2A基因扩增相关的AML患者进行了回顾性分析,并意识到了文献综述。所有病例都是男性,中位年龄为65岁。其中两个已经接受了以前的疗法。骨髓的Aspi速率涂片显示出明显的发育异常,并在红细胞系列中具有细胞质液泡。在所有情况下,细胞遗传学研究均显示出复杂的核型和原位杂交(FISH)分析(FISH)分析显示所有患者的DEL(5Q)和TP53基因的缺失和两名患者的DEL(7Q)。在两名患者中进行了下一代测序(NGS)面板,在这些情况下,建立了TP53的双重变化。所有患者均对治疗难治性,并且出现KMT2A扩增后的74天生存期。总而言之,我们的结果表明,我们的KMT2A扩增患者具有文献中描述的相同的临床和遗传特征:先前治疗,高龄,发育异常的迹象,具有频繁空泡,复杂的Karyotype和TP53突变的患者中存在扩增。