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系统已被探索作为有效的选择剂来消除未编辑的细胞,从而大大简化了细菌中的基因操作过程。9尽管基于 CRISPR/Cas 的基因组编辑方法简单且高效,但它们仍然依赖于细菌中的 HR 来实现精确的基因操作,因此难以在某些缺乏强大 HR 系统的细菌(如结核分枝杆菌)中建立。最近,脱氨酶介导的碱基编辑系统的发展为生物学中的精确基因操作提供了新策略。10 – 12碱基编辑系统使用脱氨反应和随后的 DNA 复制过程直接转换目标碱基,而不是前面提到的基于 CRISPR/Cas 的基因组编辑方法中所利用的 HR。已经建立了两种主要类型的碱基编辑系统:胞嘧啶碱基编辑器(CBE)10,11 和腺嘌呤碱基编辑器(ABE)。 12,13 CBE 已广泛用于各种生物体(包括真核生物 10,11,14 - 17 和一些细菌物种 17 - 22)中的可编程胞嘧啶到胸腺嘧啶的转化,而 ABE 主要在真核生物中建立,例如哺乳动物细胞 12,23 和植物 24,25,用于精确的腺嘌呤到鸟嘌呤的转化。最近,在链霉菌中开发了一种名为 CRISPR-aBEST 的 ABE 系统。13 此外,还开发了可编程的腺苷到肌苷和胞苷到尿苷的 RNA 编辑器。26,27

使用 Cas9 - 腺嘌呤脱氨酶融合在细菌中进行可编程腺嘌呤脱氨†

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