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尽管几种新型育种技术 (NBT) 的出现正在彻底改变农业生产过程,但尚未提供对其监管所需的技术信息。本文表明,高通量 DNA 测序可有效检测基因组编辑水稻中意外残留的外来 DNA 片段。本文提出了一种简单的 k 聚体检测方法,并通过一系列计算机模拟和实际数据分析进行了验证。数据显示,可以检测到 20 个核苷酸的短外来 DNA 片段,如果平均测序深度为 30 或更多,则忽略该片段的概率为 10 − 3 或更低,而错误命中数平均少于 1。该方法已应用于实际测序数据,并成功证明了外部 DNA 片段的存在和不存在。此外,我们的深入分析还发现了当前 DNA 测序技术的一些弱点。因此,为了进行严格的安全性评估,建议结合使用 k 聚体检测和另一种方法(例如南方印迹分析)。本研究的结果将为 NBT 产品的调控奠定基础,在 NBT 产品的生成过程中,外来 DNA 会被利用。

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