据报道,用于治疗非洲人类锥虫病(美拉胂醇)和利什曼病(五价锑剂、米替福新)的动基体在实地表现出不同程度的耐药性。动基体治疗往往尽可能采用联合疗法,例如用于治疗非洲人类锥虫病的硝呋替莫-依氟鸟氨酸联合疗法,或用于治疗利什曼病的五价锑剂加巴龙霉素/两性霉素 B 或米替福新,这些疗法的疗效和安全性受到密切监测。通过对用于治疗非洲人类锥虫病、恰加斯病和一些用于治疗内脏利什曼病的捐赠药物进行有控制的分发,世卫组织得以支持药物警戒系统,以密切监测这些药物的标准化使用、安全性和疗效。据报道,用于治疗麻风病的大多数药物(氨苯砜、利福平、氟喹诺酮类药物等)也出现了耐药性。全球麻风病消除规划可能是唯一一个有世卫组织明确指导监测抗菌素耐药性和哨点监测系统的被忽视的热带病规划。