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作物遗传多样性和种群结构评估对于标记性状关联、标记辅助育种和作物种质保护至关重要。我们分析了一组 285 个硬粒小麦种质，其中包括 215 个埃塞俄比亚硬粒小麦地方品种、10 个已发布的硬粒小麦品种、10 个来自埃塞俄比亚的先进硬粒小麦品系和 50 个来自 CIMMYT 的硬粒小麦品系。我们分别基于 11,919 个已知物理位置的 SNP 标记，调查了整个小组以及 215 个地方品种的遗传多样性和种群结构。整个小组聚类为两个种群，一方面主要代表地方品种，另一方面主要代表已发布的、先进和 CIMMYT 品系。对地方品种的进一步种群结构分析发现了 4 个亚群，强调了埃塞俄比亚硬粒小麦地方品种中高度的遗传多样性。基于两组群体结构的 AMOVA 分析表明，群体间和群体内均存在显著 (P < 0.001) 的变异。两组群体内的总变异 (81%、76%) 高于群体间的总变异 (19%、24%)。基于群体结构分析的全组和埃塞俄比亚地方品种的遗传分化 (FST) 和基因流 (Nm) 分别为 0.19 和 0.24、1.04 和 0.81，表明遗传分化程度高，基因流有限。多样性指数证实，地方品种组 (I = 0.7、He = 0.46、uHe = 0.46) 比高级品系 (I = 0.6、He = 0.42、uHe = 0.42) 更具多样性。同样，也观察到地方品种群内的差异。总之，我们发现埃塞俄比亚硬粒小麦地方品种具有很高的遗传多样性，这可能是国家和国际小麦改良计划的目标，以利用其宝贵的特性来对抗生物和非生物胁迫。
埃塞俄比亚硬粒小麦地方品种的遗传多样性
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