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在此过程中，插层通过与DNA中的鸟嘌呤碱基结合形成鸟嘌呤苯并芘。在DNA插层过程中，鸟嘌呤苯并芘插层形成加合物时观察到热力学变化，该加合物结合引起结构改变，异常复制导致基因突变。通过计算优化能量、偶极矩和静电势图等物理性质来了解分子中不同原子的不同值如何影响体系的稳定性。结果表明，所研究分子的优化能量随着分子重量和尺寸的增加而增大。复合物G-BPDE：C和C：G（3093.631kJ/mol）的优化能量在测试样品中最高。
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