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泡菜是韩国文化中常见的标志性食物，被全球公认为健康食品（Surya 和 Nugroho，2023 年）。2013 年，联合国教科文组织将泡菜制作工艺（kimjang）列入人类非物质文化遗产名录。韩国人均泡菜消费量超过大米消费量（Cha 等人，2023 年）。在韩国文化中，发酵食品起着重要作用，传统发酵是冬季储存蔬菜的主要食品加工技术之一。泡菜富含抗氧化剂、维生素、消化酶和矿物质，具有抗癌、抗糖尿病和抗炎特性（Lee 等人，2016 年）。萝卜 ( Raphanus sativus ) 可用于制作不同形式的泡菜，例如 kkakdugi 泡菜（韩国消费量第二大的泡菜）、chonggak 泡菜和 dongchimi 泡菜（Song 等人，2021 年；Surya 和 Nugroho，2023 年）。萝卜占韩国蔬菜种植总面积的 10%（https://kostat.go.kr）。韩国泡菜在全球的流行度日益提高，也增加了对韩国萝卜的需求。对萝卜可持续种植的需求正在增长。像韩国这样面积较小的国家无法增加农业面积。相反，可以借助育种科学技术培育新的植物性状来提高作物产量。随着测序等技术的发展和完善，基因组时代的育种变得更加复杂。基因组测序和组装成本持续下降的趋势加速了数字化育种方法的采用，以揭示遗传关联（Marks 等人，2021 年；Jeon 等人，2023 年）。已经开发出蔬菜作物品种来抵抗各种环境压力并满足市场对味道、香气和大小等表型的需求。在传统的育种实践中，育种者通过人工表型评估从自然界中随机选择理想的性状。所选品种的单一表型有详尽的记录，但育种者对生物特征谱（如生物和非生物胁迫抗性）的抽象与品种/性状选择并不同时进行。相反，育种者会让选定的品种经历各种交叉事件，以根据种子市场的供求开发新品种。这种方法繁琐且耗时，可以通过快速育种技术（Wanga 等人，2021 年）和基因组选择（Budhlakoti 等人，2022 年）进行改进。具体而言，通过基因组选择进行育种相对有效，而单个作物具有泛基因组，其中包括异质基因组。测序成本的降低正在鼓励植物育种
Genome of Raphanus sativus L. Bakdal, an elite line of
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