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您是生产抗原，例如重组蛋白、合成肽还是整个生物体。传统的细菌疫苗是使用整个生物体或某些细菌产生的毒素生产的。虽然亚单位疫苗由于关键蛋白质占主导地位而对大多数病毒效果很好，但对细菌或寄生虫却并非如此。为了增强对疫苗的免疫反应，已经使用了一系列佐剂，大多数兽医疫苗公司都有针对不同物种的专有佐剂。使用佐剂的替代方法是使用运载工具，例如病毒载体或最近的 mRNA。由于无法培养大多数产甲烷菌，因此减毒病原体以生产活疫苗的方法不太可能奏效。
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