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核酸杂交技术，包括聚合酶链反应（PCR），连接酶或解旋酶依赖性扩增以及转录介导的扩增，是由于高特异性和灵敏度而引起的血液培养和其他临床标本中病原体检测的有益工具（Khan，2014）。在临床实验室环境中使用基于核酸的方法检测细菌病原体，其特异性，敏感性，时间的降低和高吞吐能力，提供了“对传统微生物技术的敏感性和特异性”；但是，“污染潜力，缺乏标准化或某些测定法的验证，结果的复杂解释以及成本增加是这些测试的可能局限性”（Mothershed＆Whitney，2006年）。
使用核酸探针鉴定微生物
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