细菌鉴定是微生物学和临床诊断的关键方面。正确治疗细菌疾病和降低传染病的传播可能是由准确的细菌鉴定而导致的。传统的细菌鉴定方法(例如基于培养的技术)的准确性和速度有局限性,这可能导致延迟或无效的治疗方法。相反,分子技术为细菌鉴定提供了更快,更准确的结果。分子技术涉及使用遗传物质来鉴定细菌。PCR或聚合酶链反应是这些技术之一。通过使用DNA测序或杂交方法鉴定细菌,PCR放大了其DNA的特定区域(Järvinen等,2009)。另一种方法,DNA测序可以通过将DNA序列与参考数据库进行比较(Janda and Abbott,2007; Lasken and McLean,2014)直接鉴定细菌物种。基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱法(Maldi-Tof MS)是另一种可以通过分析细菌蛋白质的质量和电荷来迅速识别细菌的技术(Hrabák等人,2013年)。FISH或荧光原位杂交使用DNA探针,该探针与细菌DNA的特定区域杂交荧光探针进行鉴定(Wagner and Loy,2002)。此外,整个基因组测序(WGS)涉及整个细菌基因组的测序,从而可以更深入地研究细菌物种和遗传特征(Maguvu和Bezuidenhout,2021)。在这里,我们概述了这些各种方法,包括它们的应用程序,优势和限制。
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