粪便样品分析提供了一种简单的,无创的方法,用于检测多种引起疾病的微生物,生物标志物检测消化道的癌症,以分析肠道微生物组及其对生理健康和疾病的影响。对肠道微生物组的分子检查可以为细菌组成提供宝贵的见解,并可以作为预测胃肠道疾病治疗结果的早期筛查工具。但是,由于存在多酚,腐殖酸,脂质和其他抑制PCR的化合物,因此粪便是一个复杂的样品源。为了实现其巨大的临床潜力,需要从粪便中提取高质量的DNA,不含PCR抑制剂,以自动化的高通量格式提取。为了满足这一需求,Omega Bio-Tek开发了一种用多种磁珠的试剂盒,称为Mag-Bind®通用病原体96套件,用于从包括粪便在内的各种样本类型的病原体检测。在本申请说明中,我们使用Mag-Bind®通用病原体96套件在Chroma Ate的MagXtract 3200上提供了从粪便样品中提取DNA的自动工作流程。下表1中描述了Chroma Ate的MagXtract 3200系统的产品规格。申请说明还讨论了使用实时PCR的DNA产量,质量和扩增潜力的自动化工作流程的性能。
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