恶性脑瘤胶质母细胞瘤多形(GBM)显示出重要水平的细胞塑性。经常假定肿瘤微环境(TME)是GBM细胞状态的,但我们对GBM Tumers的空间组织和TME衍生的信号驱动恶性细胞状态过渡的空间组织知之甚少。在这里,我将预先发送一种集成的单细胞和空间多摩管方法,以解决GBM的组织插曲。首先,我将提出Cell2Location,这是一种新的计算工具,可以在空间转录组数据中映射细粒细胞类型。第二,我将提出GBM-Space,这是一种新的协作努力,以使用多模式基因组学发现TME-GBM相互作用。使用联合单细胞转录组和表观基因组分析,我们定义了当前的恶性细胞态,并扩展了TME细胞的描述。使用覆盖空间RNA测序,我们介绍了不同的肿瘤部位,并观察到GBM微环境的显着区域 - 异质性。最后,我们使用Cell2Location整合了单细胞和空间转录组学,并发现恶性细胞态在GBM中逐渐分离并与不同的TME相关。我们的努力揭示了GBM肿瘤的新空间组织,并确定了调节恶性细胞状态的假定TME信号。
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