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RNA 加工和代谢在细胞内受到精确调控，以确保 RNA 的完整性和功能。尽管随着 CRISPR-Cas13 系统的发现和改造，靶向 RNA 工程已成为可能，但同时调节不同的 RNA 加工步骤仍然无法实现。此外，与 dCas13 融合的效应物导致的脱靶事件限制了其应用。在这里，我们开发了一个新平台，通过 S 支架标记的 gRNA 进行组合 RNA 工程 (CREST)，它可以同时对不同的 RNA 靶标执行多种 RNA 调节功能。在 CREST 中，RNA 支架附加到 Cas13 gRNA 的 3' 端，其同源 RNA 结合蛋白与酶结构域融合以进行操作。以 RNA 可变剪接、A 到 G 和 C 到 U 碱基编辑为例，我们开发了双功能和三功能 CREST 系统，用于同时进行 RNA 操作。此外，通过将 ADAR2 脱氨酶结构域的两个分裂片段分别与 dCas13 和/或 PUFc 融合，我们重建了其在靶位点的酶活性。这种分裂设计可以减少近 99% 的脱靶事件，而这些事件通常是由全长效应物引起的。CREST 框架的灵活性将丰富用于研究 RNA 生物学的转录组工程工具箱。
通过 CRISPR RNA 支架同时进行多功能转录组工程。
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