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补充图 1 | ERD7 转基因拟南芥突变株系的生成和表征。(A)根据 TAIR 提供的信息,描绘了拟南芥 ERD7 ORF (AT2G17840.1) 的插图,左侧为 5' 端。标示了 ERD7 基因外显子(框)和内含子(线)以及在相应的单拷贝、T 3 纯合 erd7-1 和 erd7-2 突变株系中针对 CRISPR/Cas9 基因组编辑的 T-DNA 插入和 sgRNA 区域的相对位置。还显示了 (C) 中用于基因分型和 RT-PCR 分析的引物对的相对位置。 (B) 野生型和 erd7-2 突变株系中 ERD7 基因和蛋白质的核苷酸和推导多肽序列的比较,表明 ERD7 基因(和相应的转录本)中预期有 1711 个核苷酸缺失,导致 erd7-2 突变株系中编码蛋白质有 398 个氨基酸缺失。ERD7 野生型和 erd7-2 突变体 DNA 序列中 CRISPR/Cas9 原间隔区相邻基序带下划线。使用 ClustalO 算法 (ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo) (Madeira et al., 2019) 对野生型和突变型 ERD7 蛋白质的推导氨基酸序列进行比对。(C) erd7-1 和 erd7-2 突变株系的 PCR 和 RT-PCR 分析。图中显示的是从 15 天大的 WT、erd7-1 和 erd7-2 植物的莲座叶中提取的 gDNA 的 PCR 分析(上图)和 mRNA 的 RT-PCR 分析(下图),并使用所示引物对进行评估;引物对的位置参见 (A)。有关用于生成和表征两个 erd7 突变系的所有引物序列,另请参阅补充表 1。通过 DNA 凝胶电泳和溴化乙锭染色分析 PCR 产物和 RT-PCR 产物。注意,在两个突变系中均不存在分别对应于 ERD7 基因和 ERD7 表达(即转录本)的 PCR 和 RT-PCR 产物,而 erd7-1 突变体中存在 T-DNA,这与预期一致。拟南芥 TUB4 用作内源对照。

补充图1

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