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确定化学物质与毒性靶标相互作用的能力,例如不良结局途径中的蛋白质,是药物发现和风险评估的重要步骤。筛选化学毒性目标相互作用的计算方法可以作为传统体外 /体内方法的快速替代方法。在这项工作中,我们开发了一种基于化学相似的方案,该方案可以预测化学物质与64个已建立的毒性靶标相互作用的潜力。特别是,我们从公共数据源创建了一个化学基因组学数据库,以识别目标代表,即已知与所选靶标相互作用的化学物质。我们使用Chembl数据库的外部评估集在正确排名的已知相互作用化合物中评估了2D和3D相似性方法的性能。我们发现2D方法在目标预测中的表现优于3D方法。在这里,我们使用基于2D相似性的筛选方法开发了一种公开可用的毒性profiler网站(https://toxpro.bhsai.org/),该方法允许用户为一组查询化合物获得毒性目标配置文件。我们将探测器用于屏幕649已知的急性和剧毒化学物质,全球统一系统(GHS)得分小于2。在此组中,乙酰胆碱酯酶是毒性的最常见目标。开发的毒性特性工具提供了一种快速筛选化学毒性的机制的方法。

基于化学相似性的毒性目标探测器

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