抽象背景肿瘤突变负担(TMB)是最近提出的实体瘤免疫疗法的预测生物标志物,包括非小细胞肺癌(NSCLC)。可用的TMB确定测定方法在水平覆盖率,基因含量和算法上有所不同,从而导致结果差异,从而影响患者的选择。迫切需要对NSCLC患者队列中TMB评估的协调研究。方法我们评估了使用两个销售的下一代测序面板获得的TMB评估:Trusight Oncology 500(TSO500)和96 NSCLC样品中的参考分析(Foundation One,FO)与参考分析(FOSTION ONE,FO)相比。此外,我们研究了三种方法与肿瘤中PD-L1表达的一致性水平,检查了不同免疫浸润与TMB的水平,并进行了实验室间可重复性研究。最后,确定了调整后的截止值。结果两个面板都与FO相一致,一致性相关系数(CCC)为0.933(95%CI 0.908至0.959),用于OTML的0.933(95%CI 0.908至0.959)和0.881(95%CI 0.840至0.922)。相应的CCC为0.951(TSO500-FO)和0.919(OTML-FO),在具有PD-L1的细胞<1%(PD-L1 <1%; N = 55)和0.861(TSO500-FO)和0.722(OTML-FO)的肿瘤中,pD-L1(pd-L1 <1%; n = 55)和0.722(otml-fo)(otml-fo)(otml-fo)(otml-fo)(otml-fo)(otml-fo),带有PD-L1%(n = 41%)(n = 41%)。实验室间的可重复性分析显示,TSO500的可重复性更高。在免疫浸润与TMB方面没有发现显着差异。结论两个面板在TMB评估中均表现出强大的分析性能,并且更强调整后的截止值对应于10个MUTS/MB的FO需要降低到7.847 MUTS/MB(TSO500)和8.380 MUTS/MB(OTML),以确保灵敏度> 88%。随着这些临界值的阳性预测值为78.57%(95%CI 67.82至89.32),负预测值为87.50%(95%CI 77.25至97.75)的TSO500,而OTML则为OTML,而OTML为73.33%(95%CI 62.142.14至84.52)和84.52)至84.52)至84.52)至84.52)至84.52)至84.52)至84.52)至84.52)(84.52)至84.52)分别为74.81至97.41)。
主要关键词