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使用转录组数据的药物重新定位研究最近引起了人们的关注。In this study, we attempted to identify new target proteins of the urotensin-II receptor antagonist, KR-37524 (4-(3-bromo-4-(piperidin-4-yloxy)benzyl)- N -(3-(dimethylamino)phenyl)piperazine-1-carboxamide dihydrochloride), using a transcriptome-based drug repositioning approach.为此，我们获得了KR-37524诱导的基因表达分布在四种细胞系（A375，A549，MCF7和PC3）中的变化，并将其与鉴于lincs L1000数据库中可用的药物诱导的基因表达变化的变化进行了比较，以识别出批准的基因表达谱的识别基因表达谱的变化。此处，使用连接得分计算两个基因表达谱变化之间的相似性。然后，我们选择了在每种细胞系中连通性评分最高（总共12种药物）作为KR-37524的潜在靶标的最高连通性评分的最高连接性评分的蛋白质。使用体外结合测定法实验证实了七个潜在的靶蛋白。通过此分析，我们确定了神经学调节的5-羟色胺转运蛋白是KR-37524的新靶蛋白。这些结果表明，基于转录组的药物重新定位方法可用于识别给定化合物的新靶蛋白，我们提供了本研究中开发的独立软件，该软件将作为药物重新定位的有用工具。
识别尿素蛋白 - II的新靶蛋白...
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