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从转录到蛋白质合成的道路铺有许多障碍,从而允许几种基因表达的转录后调节模式。mRNA生物学中的基本参与者是DDX3X,它是一种RNA结合蛋白,可通过规范调节mRNA翻译。通过监测DDX3X耗竭后的mRNA丰度和翻译的动力学,我们观察到翻译抑制的mRNA的稳定。我们使用可靠的统计学习模型来发现编码序列中的GC含量作为RNA稳定的主要特征。该结果证实了在其他研究中可检测到的与GC含量相关的mRNA调控,包括数百个编码数据集和最近关注细胞周期中mRNA动力学的工作。我们通过详细分析了数百个样品中的RNA-seq Pro填充物,包括表现出细胞周期和神经发生缺陷的DDX3X敲除小鼠模型,提供了进一步的mRNA稳定证据。我们的研究确定了mRNA调节的根本特征,并强调了量化基因表达级联的多个步骤的重要性,其中通常将RNA丰度和蛋白质的产生均未偶联。

无处不在的GC含量签名是由DDX3X

无处不在的GC含量签名是由DDX3XPDF文件第1页

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