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g蛋白偶联受体(GPCR)在各种生理过程中起关键作用,并成为7个关键靶标的药物发现靶标。肽是针对8种GPCR的特别引人注目的治疗剂,因为它们经常表现出优异的亲和力,选择性和效力。然而,GPCR的动态构象状态深刻影响其与配体的相互作用10,强调了对肽设计中特定国家特定策略的需求。为了解决这个问题,11我们开发了针对GPCR的有效状态特异性肽设计框架。此方法12包括对GPCR状态转变机制的分析和特殊优化的肽结构13 GPCR,Helixfold-Multistate的预测模型,从而使我们能够评估14个设计肽的状态特异性分数。在最近的GPCR肽PDB上,HelixFold-Multistate不仅保持GPCR 15活性状态,类似于Alphafold-Multistate,而且还表现出高相互作用预测能力16与Alphafold-Multimer在Dockq和IRMS方面相当。对CXCR4肽亲和力的实验17数据表明,其置信度得分比Alphafold-Multistate的18个具有更高的相关性和筛选能力。通过采用这种设计方法,我们成功地鉴定了生长激素促促促素受体(GHSR)和Apelin受体20(APJ)的激动剂19和拮抗剂肽,分别表现出低于100 nm和10 nm的EC50值。尽管拮抗剂21肽面临挑战,但我们的方法还鉴定了GHSR和APJ的抑制剂,其IC50值分别为3.3 µm和22 20.3 µm。23 div>

针对G蛋白偶联受体的状态特异性肽设计

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