“乳酸细菌基因组联盟”(LABGC)。LABGC的任务是在实验室上转发功能基因组研究。每个实验室菌株均与指定的研究者有关,他们将主要负责闭合差距和出版基因组序列。在2002年,JGI生成了11个名称的草稿序列。这是通过对每个微生物DNA的shot弹枪小插入库(2-3 kb)进行测序来实现的,以达到10倍的覆盖范围。在可能的情况下,该覆盖范围得到了来自大插入宇宙库(40 kb)的5倍覆盖范围。将序列数据合并到一个组件中,然后订购为支架。然后,橡树岭国家实验室对草稿序列进行了计算注释。可以从联合基因组研究所网站(http://www.jgi.doe.gov/)中查看此注释。该网站还允许研究人员通过代谢途径或功能基因类别的“注释草案”扫描。此外,可以通过网站内的基本局部比对搜索工具(BLAST)工具进行特定的DNA或蛋白质搜索。LABGC集团目前正在与一家私人公司Fidelity Systems合作,以关闭所有11个基因组,并期望在2004年完成。在LABGC项目中完成和发布基因组测序将是自100年前最初隔离和使用乳酸启动培养物以来实验室研究中最重要的英里。此外,累积序列数据的公众可用性将促进对美国和国外实验室的基因组学研究的实施。在美国,这些微生物与20至300亿美元的食品产生至关重要,因此这一里程碑将对食品和饮料发酵行业产生重大影响。
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