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最近的生物技术进步导致单细胞研究数量不断增加，这些研究揭示了对大量扰动的分子和表型反应。然而，跨不同数据集的分析通常受到格式、命名约定、数据过滤和规范化差异的阻碍。为了促进系统生物学计算方法的开发和基准测试，我们收集了一组 44 个公开可用的单细胞扰动响应数据集，其中包含分子读数，包括转录组学、蛋白质组学和表观基因组学。我们应用统一的预处理和质量控制流程并协调特征注释。由此产生的信息资源使计算分析方法的开发和测试成为可能，并促进了跨数据集的直接比较和集成。使用这些数据集，我们展示了 E-distance 在量化扰动相似性和强度方面的应用。这项工作为处理单细胞扰动数据的研究人员提供了信息资源和指南，并强调了新实验的概念考虑。数据可在 scperturb.org 上公开获取。
scPerturb：协调单一信息资源......
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