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摘要 在某些情况下,药物组合通过结合相同的蛋白质来影响不良结果表型;然而,药物结合蛋白通过细胞内的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络相关联,这表明药物表型可能是由远程网络效应引起的。我们首先使用 PPI 网络分析根据药物靶标下游的蛋白质对药物进行分类,然后预测药物组合效应,其中药物共享网络蛋白质但具有不同的结合蛋白(例如靶标、酶或转运蛋白)。通过使用下游蛋白质对药物进行分类,我们对黄金标准数据集中记录的罕见药物组合效应的预测灵敏度为 80.7%。我们进一步使用电子健康记录中的新观察性研究测量了预测的药物组合对不良结果表型的影响。我们测试了 60 个网络药物类别对 7 种不良结果的预测,并测量了预测组合的临床结果变化。这些结果展示了一种使用药物靶标下游蛋白质预测药物协同作用的新范例。

网络范式利用下游蛋白质-蛋白质相互作用预测药物协同作用

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