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胞嘧啶碱基编辑器 (CBE) 可实现可编程的基因组 C·G 到 T·A 转换突变,通常包含经过修饰的 CRISPR-Cas 酶、天然存在的胞嘧啶脱氨酶和尿嘧啶修复抑制剂。先前的研究表明,利用天然存在的胞嘧啶脱氨酶的 CBE 可能导致无引导的全基因组胞嘧啶脱氨。尽管随后报道了可减少随机全基因组脱靶的改进型 CBE,但这些编辑器的靶向性能可能不理想。本文,我们报告了使用 TadA 的工程变体 (CBE-T) 的 CBE 的生成和表征,这些变体可在序列多样的基因组位点上实现高靶向 C·G 到 T·A,在原代细胞中表现出强大的活性,并且不会导致全基因组突变的可检测升高。此外,我们报道了胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑器 (CABE),它们可催化 A 到 I 和 C 到 U 编辑 (CABE-T)。与 ABE 一起,CBE-T 和 CABE-T 可使用实验室进化的 TadA 变体对所有转换突变进行可编程安装,与之前报道的 CBE 相比,这些变体具有更好的特性。

由 TadA 变体生成的改进的胞嘧啶碱基编辑器

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