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所有培养生物体中都会自发出现突变和重组等遗传变异。虽然可以通过选择或反选择来识别非中性突变,但在异质群体中识别中性突变通常需要昂贵且耗时的方法,例如定量或液滴聚合酶链反应和高通量测序。在不断变化的环境条件下,中性突变甚至可能成为主导,从而强制进行暂时选择或反选择。我们提出了一种新方法,我们称之为 qSanger,使用来自混合 Sanger 测序读数的对齐电泳图峰的振幅比来量化 DNA。表达增强型绿色荧光蛋白和 mCherry 荧光标记的质粒用于通过定量聚合酶链反应和荧光定量在体外和共转化大肠杆菌中验证 qSanger。我们表明,qSanger 允许从混合 Sanger 测序读数中量化遗传变异,包括单碱基天然多态性或从头突变,与标准方法相比,大大减少了劳动力和成本。

qSanger:通过桑格测序对细菌培养物中的遗传变异进行量化

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