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摘要 COVID-19 已严重影响医院感染预防和控制 (IPC) 实践，尤其是在重症监护病房 (ICU)。这经常导致多重耐药菌 (MDRO) 的传播，包括耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 (CRAB)。本文，我们报告了意大利一家大型 ICU COVID-19 中心医院的 CRAB 疫情管理情况，并通过全基因组测序 (WGS) 进行了回顾性基因型分析。通过 WGS 分析了 2020 年 10 月至 2021 年 5 月期间被诊断为 CRAB 感染或定植的重症 COVID-19 机械通气患者身上获得的细菌菌株，以评估抗菌素耐药性和毒力基因以及可移动遗传元素。结合流行病学数据，系统发育分析用于识别推定的传播链。 40 例中 14 例 (35%) 被诊断为 CRAB 感染，40 例中 26 例 (65%) 被诊断为定植，7 例 (17.5%) 在入院后 48 小时内分离出 CRAB。所有 CRAB 菌株均属于巴斯德序列 2 型 (ST2) 和 5 种不同的牛津 ST，并呈现携带 bla OXA-23 基因的 Tn 2006 转座子。系统发育分析显示，ICU 内部和ICU 之间存在四条传播链，主要在 11 月至 2021 年 1 月期间传播。量身定制的 IPC 策略由 5 点捆绑组成，包括 ICU 模块临时转换为 CRAB-ICU 和动态重新开放，对 ICU 入院率的影响有限。实施后，未检测到 CRAB 传播链。我们的研究强调了将经典流行病学研究与基因组研究相结合以确定疫情期间的传播途径的潜力，这可能是确保 IPC 策略和防止 MDRO 传播的有力工具。
卡巴培南耐药的基因组表征
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