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There is an important role for direct sequencing of patient samples to complement traditional culture-based methods for bacterial sexually transmitted infections (STIs), effectively overcoming limitations posed by fastidious or unculturable pathogens such as Neisseria gonorrhoeae , Treponema pallidum , Mycoplasma genitalium and Chlamydia trachomatis .元基因组技术有效性可以在没有培养的分离株的情况下对抗菌耐药性（AMR），应变键入和微生物组分析进行分析，从而为理解流行病学趋势和指导目标疗法提供关键信息。尽管取得了重大进展，但Chal Lenges仍然存在，例如成本，生物信息学的复杂性和道德考虑。本文讨论了当前的应用，技术创新和未来的前景，将宏基因组学整合到常规的细菌性STI监视中，强调需要确定成本和时间效益的工作流以及增强基因组数据的可访问性。通过应对这些挑战，直接测序有望填补AMR监测和病原体键入中的关键空白，从而提供了新的途径，以增强公共卫生策略，以打击全球细菌性传播疾病。
细菌性传播感染的直接测序技术
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