最近,研究调查了反刍动物本地微生物组的作用,而微生物在甲烷(CH 4)生产和缓解措施中的作用。但是,微生物组研究之间的变化使实施有影响力的策略变得困难。这项研究的第一个目标是识别,总结,编译和讨论有关CH 4细节策略的当前文献,以及它们如何与本地反刍动物微生物组相互作用。第二个目标是对已识别的16S rRNA测序数据进行荟萃分析。将对使用科学,Scopus,Agris和Google Scholar的文献进行搜索。合格的标准将使用PICO(种群,干预,比较器和结果)元素定义。将使用两个独立的审阅者进行文献搜索和数据汇编。将使用Cochrane风险偏见2.0工具评估偏见的风险。将使用适当的提取方法从NCBI序列阅读档案,欧洲核苷酸档案或类似数据库下载公开可用的16S rRNA扩增基因测序数据。将按照标准化协议使用QIIME2进行数据处理。荟萃分析将对alpha和beta多样性以及分类学分析进行。Alpha多样性指标将使用Benjamini-Hochberg多重测试校正的Kruskal-Wallis检验进行测试。beta多样性将使用带有多个测试校正的永久测试进行统计测试。研究之间的异质性将使用I 2统计量进行评估。对冲的G标准化平均差异统计量将使用95%的置信区间来计算固定和随机效应模型估计。潜在的出版偏见将通过Begg的相关测试和Egger的回归测试进一步评估。等级方法将用于评估证据的确定性。以下方案将用于指导未来的研究和荟萃分析,以调查CH 4缓解策略和反刍动物微生物生态学。未来的工作可用于增强牲畜控制技术。该协议在开放科学框架(https://osf.io/vt56c)中注册,并在动物和食物的系统 - ATIC评论(https://www.syreaf.org/contact)中获得。
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