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•可行真菌(酵母和霉菌)和细菌指示剂的枚举,包括对选定抗菌抗性(Escherichia coli(E. coli)(大肠杆菌)耐药性的变体)和推定的扩展谱β-内乳酰胺酶(ESBL)产生E. coli和E. coli和E. coli和entoccus spp。和万古霉素抗性肠球菌属。(vre))。选择指标生物是基于对环境AMR监视的测试方法的先前综述。•培养的细菌和真菌分离株的抗菌易感性测试(AST),以鉴定指标物种中较宽的抗菌耐药性。•培养的细菌分离株的整个基因组测序(WGS),以鉴定抗菌抗性基因和抗性分离株的基因型。•短读和长读shot弹枪宏基因组测序和16S rRNA metabarcoding分别确定抗菌抗性基因和微生物群落组成的存在。•高通量芯片阵列QPCR(HT-QPCR)确定靶向组的相对丰度最多384个抗菌抗性基因。•对41种抗生素物质进行化学分析,包括抗生素,抗真菌剂和杀菌剂以及其他水质和环境相关的参数,以评估其在所研究的水体中的存在并确定潜在的AMR选择压力。

英格兰河流集水区抗菌抗性的试点监视

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