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现在几乎可以测量植物的所有部分,但是评估植物基因组的大小仍然具有挑战性。尽管可以在显微镜下测量染色体大小(Albini,1994),但通常未知单细胞中所有DNA分子的合并长度。在第一个拟南芥基因组序列释放近25年后,对于最重要的模型之一而言,这甚至是正确的。最初,诸如Reassociation Kinetics之类的生化方法(Leutwiler等人,1984),Feulgen光度法(Bennett&Smith,1991),定量凝胶印迹杂交(Francis等人。,1990年),Southern印迹(Fransz等人,2002)和流式细胞仪(Arumuganathan&Earle,1991; Bennett&Leitch,2011)。不幸的是,这些实验方法依赖参考基因组(Bennett等人。,2003)。下一代测序技术的兴起(Metzker,2010年)启用了基于K-MER配置文件或唯一K-Mers计数的新方法(Li&Waterman,2003;Marçais&Kingsford,2011年)。水母(Marçais&Kingsford,2011年),Kmergenie(Chikhi&Medvedev,2014年),

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