机构名称：
¥ 4.0
CRISPR-Cas9 编辑是一种可扩展的生物通路映射技术，但据报道会导致基因组发生各种不希望出现的大规模结构变化。我们对原代人类细胞中的基因组进行了阵列式 CRISPR-Cas9 扫描，以 101,029 个指导基因为靶点敲除 17,065 个基因。高维表型组学揭示了一种“邻近偏差”，其中 CRISPR 敲除与同一染色体臂上生物学上不相关的基因的敲除具有意想不到的表型相似性，重现了典型的基因组结构和结构变异。转录组学将邻近偏差与染色体臂截断联系起来。对已发表的大规模敲除和敲减实验的分析证实，这种影响在细胞类型、实验室、Cas9 递送机制和检测方式中普遍存在，并表明邻近偏差是由 DNA 双链断裂引起的，细胞周期控制起着中介作用。最后，我们展示了一种针对大规模 CRISPR 筛选的简单校正方法，以减轻这种普遍存在的偏见，同时保留生物学关系。
高分辨率全基因组染色体映射...
主要关键词
相关文件推荐
