动机:细胞的分子身份是由于异质分子层之间的复杂相互作用而产生的。单细胞测序技术的最新进展已经开放了测量这种调节分子层的可能性。结果:在这里,我们提出了鹰嘴豆泥,这是一种从单细胞多摩管数据中推断监管机制的新方法。与最先进的鹰嘴豆泥不同,鹰嘴豆泥捕获了生物学大分子之间的合作,并且可以轻松地包括分子调节的其他层。我们在配对和未配对的多摩尼斯数据集上的最先进的鹰嘴豆泥基准了鹰嘴豆泥。我们的结果证明了鹰嘴豆泥在转录因子(TF)目标,TF结合基序和调节区域预测方面提供的改进。最后,一旦应用于小鼠脑皮层的SNMC-Seq,SCATAC-SEQ和SCRNA-SEQ数据,Hummus启用了鹰嘴豆泥,可以准确地群集SCRNA轮廓并识别潜在的驱动程序TF。
主要关键词