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18世纪和19世纪初的博物学家将这种等级制度比作“生命之树”，这是Darwin（1859）在物种起源中采用的类比，是描述生物的相互联系的进化历史的手段。因此，由Linnaeus设计的分类方案被重新解释为系统发育，不仅表明物种之间的相似性，还表明其进化关系。历史这个分支在20世纪初出现，随着蛋白质测序的出现。 PCR，电泳和其他分子生物学技术。在1904年，Nuttal使用血清学交叉反应来推断生物之间的关系。.1950的分子技术，例如蛋白质测序和淀粉凝胶电泳，引入了进化研究。1960'S-1970的分子数据用于较高级别的系统发育重建（例如阶和类）。1985PCR的发展（聚合酶链反应）的发展导致系统发育重建的活性水平。分子系统发育的目标
分子系统发育
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