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描述DepMap软件包是一个数据包,该数据包使用Broad Institute DepMap Cancer依赖性研究使用实验室。可用的数据集可用,包括RNAi和CRISPR-CAS9基因敲除筛查量量化精选癌细胞系的遗传依赖性。其他数据集也可用于与选择细胞系的基因的日志拷贝数,通过反相蛋白质裂解的蛋白质表达,通过反相裂解的蛋白质裂解物微阵列(RPPA),“百万到百万)(TPM)数据(TPM)数据,以及包含元数据和突变的补充数据集,并在当前释放中发现了其他数据集。19Q3释放添加了Drug_Depentency数据集,该数据集包含有关药物和药物候选化合物的癌细胞系依赖数据。20Q2释放添加了蛋白质组学数据集,该数据集包含通过质谱法对蛋白质进行定量分析。该软件包将每季度更新,以合并最新的广泛研究所的公共癌症依赖性数据集。该软件包中提供的所有数据都是由Broad Institute DepMap生成的,用于研究目的,而不是用于临床使用。此数据根据创意共享许可(属性4.0国际(CC By 4.0))分发。

DEPMAP:癌症依赖图数据包

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