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项目建议表观遗传异质性是一种新型治疗抗性急性髓样白血病（AML）的新型驱动力，是一种侵略性的血液癌，总体生存率较低，复发率很高。表观遗传失调在疾病进展中起着重要作用，因为表观遗传调节剂经常因缺失而丢失并进入单倍性调节剂。此外，现已将表观遗传药物用作标准治疗[1]。最近的一项研究表明，诊断时白血病细胞池的表观遗传异质性可归因于大约40％的复发。虽然可以使用大量方法来量化表观基因组异质性，但了解特定表观遗传构型和复发之间的关系需要单细胞方法。了解表观基因组异质性以及诸如MNX1等癌基因的激活如何导致加速肿瘤发生或耐药性对于改善AML治疗至关重要。我们推测，表观遗传调节剂的单倍不足会导致表观基因组异质性的水平升高，从而导致肿瘤发生和耐药性加速。在此项目中，临床医生将在诊断和复发中介绍来自AML患者的样本，以了解导致复发的特定表观遗传构型。我们将使用各种表观遗传构型的读数，包括单细胞ATAC-SEQ，用于分析染色质的可及性和SCTAM-SEQ，用于分析DNA甲基化[4]。该项目将需要对现有的批量数据进行分析，以查明该部门已经生成的较大人群中的变量区域，然后可以在单细胞级别上以更多详细信息进行介绍。除了在DKFZ的单细胞开放式实验室中执行单细胞测定外，该项目还将有一个大的计算部分，分析生成的数据也与批量数据有关。最终，我们将探索表观遗传调节，这是AML以外的癌症抗药性的主要标志（例如肺癌，前列腺癌），为精密医学铺平了道路。
项目摘要
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