突尼斯公民科学家技术总监。摘要MSAKEN CITY(突尼斯)被认为是由五名从西亚迁移的相关男子在公元1360年左右建立的。人口将随着这些创始人的后代以及来自突尼斯不同地区的其他人口的到来而发展。为了阐明创始人人口的TMRCA并揭示其地理起源,使用商业公司的服务检查了来自MSAKEN不同家族的23名男性,使用NG测试技术检查了12至440 Y的染色体短串联重复序(STR)和单核苷酸多态性(SNP)标记。八个样品被基因分型用于SNP,以确定其单倍群。为了完善系统发育,在一个样品上以300,000 bp的速度进行了传统的Sanger测试(在Y Chr中步行中)。还使用下一代测试(BIGY)测试了七个样本(BIGY),其中涵盖了2000万bp的Y染色体,重叠了85%的黄金标准区域(通过YCC将其放置在系统发育树上的染色体Y位置),使用NGS Instruments,Hiseq 2000和2500和2500和2500。使用SQL脚本和数据挖掘工具,对STR结果与来自不同来源和数据库的数据进行了比较,以查找匹配的单倍型。发现所有STR结果的每12个标记不超过三个不匹配,每67个标记不超过6个不匹配,而SNP结果表明,所有测试样品均属于其子组中的单倍群J-M172。依靠通用的Str标记值,我们定义了MSAKEN-HAPLOTYPE。ng测试我们的样品以及添加到yfull.com树中的测试使我们能够完善J-L24的系统发育,并发现样品均属于J-L271单倍群,共享54个独家SNP。基于NG测试的最新共同祖先(TMRCA)的计算时间,范围为1500至6200 YBP,显示出约5400 YBP的强瓶颈。收集结果的变化显示了东安纳托利亚,当今亚美尼亚,阿塞拜疆和西伊朗的J-L192的地理根。属于J-M172(J2)单倍群的随机突尼斯STR单倍型的20%至30%表现出MSAKEN-HAPLOTYPE。关键词:MSAKEN DNA;突尼斯DNA; salar dna;中国DNA;单倍群J2
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