C-Met酪氨酸激酶结构域的两个X射线晶体结构; PDB代码:分别从蛋白质数据库(www.rcsb.org)中检索出野生和突变体类型的4xyf [1]和2RFS [2]。为了确定导致C-MET,ABL1和IGF1R之间亲和力差异的结构基础,也从蛋白质数据库中获得了ABL1(PDB代码:3OXZ [3])和IGF1R(PDB代码:1JQH [4])的晶体结构。实施了蛋白质制备向导,以制备每种蛋白质的激酶结构域。该蛋白质是通过分配键订单,添加氢,创建二硫键和使用ProPKA(丹麦詹森研究小组)优化H键网络来重新处理的。最后,使用优化的液体模拟电势(OPLS_2005,Schrödinger)力场应用了0.30°A的RMSD值的能量最小化。