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线虫的遗传研究已由秀丽隐杆线虫作为模型物种主导。缺乏基因组资源使遗传研究扩展到其他线虫群体。在这里,我们报告了Mermithid线虫Mermis Nigrescens的基因组组装草案。Mermithidae是昆虫寄生的线虫,带有宿主,包括各种陆地节肢动物。我们使用纳米长读数和10倍铬链路读取了nigrescens M. nigrescens的整个基因组。组件的尺寸为524 MB,由867个脚手架组成。N50值为2.42 MB,一半的组装中的一半在30个最长的脚手架中。来自真核生物数据库(Eukaryota_odb10)的组装BUSCO分数表明基因组为86.7%,而5.1%的基因组为5.1%。基因组具有高水平的杂合性(6.6%),重复含量为83.98%。mRNA-seq从不同尺寸的NEMA TOD(≤2cm,3.5–7 cm和> 7 cm的身体长度)中读取,代表不同的发育阶段,并用于基因组注释。使用AB的初始和基于证据的基因模型预测,注释了12,313个蛋白质编码基因和24,186个mRNA。这些基因组资源将有助于研究人员调查生物学和宿主 - 寄生虫的各个方面。

基因组组装和人膜线虫的注释Mermis nigrescens

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