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Archimedes实验：量子真空可以感觉到重力吗？
每个节点•2 x 6240r（24芯2.4 GHz 165W）CPU•192 GB DDR4•10 GBPS以太网•2 x 800GB NVME SSD•HDR 100 Mellanox NIC•3.675 TF峰（68％RMAX）•40 port hdr 200 hdr 200 empe•14.75 tf•14.75 tf（64. 1％）
利用 CRISPR/Cas9 系统寻找新型重组修复增强子
研究成果概要（中文）：CRISPR-Cas9 是一种多功能技术，可应用于医疗。在 DNA 双链断裂后的修复途径中，与模板 DNA 同源重组 (HDR) 的修复有助于精确编辑，但同时，涉及碱基缺失或插入的 NHEJ 也以高频率发生。我使用 Traffic Light Reporter 系统进行了基于细胞的 HDR 增强因子筛选，该系统可以同时检测具有 HDR 和 NHEJ 的细胞，并确定了与 NHEJ 衍生细胞相比，HDR 衍生细胞中表达较高的几个基因。对这些基因的进一步基因本体分析表明，它们与 DNA 修复和细胞周期有关。
程序：干预策略 - 圣母大学
4.2 如果确定某位学生需要采取干预策略，则校长（或指定的学术人员）或主要督导员和 HDR 协调员（对于 HDR 学生）应联系该学生并尽快安排与其进行个人面谈。 4.3 如果无法联系到学生或学生未回应，则应记录联系学生安排面谈的尝试并将其保存在学生档案中。 4.4 干预策略表应用于帮助讨论影响学生入学或学业成绩的问题。校长（或指定的学术人员）或主要督导员和 HDR 协调员（对于 HDR 学生）应考虑批准干预策略的后果，因为该策略将影响国际学生的课程时长（如入学确认书 (CoE) 中所述）和学生签证。 4.5 校长（或指定的学术人员）或主要督导员和 HDR 协调员（如果是 HDR 学生）在面试国际学生以制定干预策略时，必须考虑学生当前的 CoE 完成日期，该日期由学生管理部门在每个学习期开始时提供。干预策略表中必须包含此日期，并在为国际学生启动干预策略时将其考虑在内。4.6 校长（或指定的学术人员）应与学生讨论他们目前在给定学习期间所注册的课程（或在给定教学期间将注册的课程），并确定这些课程是否仍然适合学生的学术能力和学生是否满足课程要求。4.7 干预策略必须由学生和校长（或指定的学术人员）或主要督导员和 HDR 协调员（如果是 HDR 学生）共同签署并注明日期，以使其有效。必须将原件连同所有支持性证据一起转发给学生管理部门和研究办公室（如果是 HDR 学生），并将副本保存在学生的学校档案中。还必须向学生提供干预策略的副本。学生管理部门将根据需要采取行动。
递归编辑通过重新定位不想要的结果来改善同源指导的维修
CRISPR-CAS诱导的同源指导修复（HDR）可以通过外源供体模板安装广泛的精确基因组修饰。然而，HDR在人类细胞中的应用通常受到差异差的效率阻碍，这是由于偏爱易于容易产生的途径而产生短插入和缺失的途径。在这里，我们描述了递归编辑，这是一种HDR改进策略，该策略有选择地重新制定不希望的Indel结果，以创造更多的机会来生产所需的HDR等位基因。我们介绍了一个名为Retarget的软件工具，该工具可以使递归编辑实验的合理设计。在单个编辑反应中，使用重编设计的指南RNA，递归编辑可以同时提高HDR效率并减少不希望的indels。我们还利用重新定位来生成数据库，以特别有效地递归编辑位点，以内源性标记蛋白质并靶向致病性突变。递归编辑构成了一种易于使用的方法，而没有潜在的细胞操作，也很少增加实验负担。
利用 DNA-PKcs 抑制技术在人类原代细胞中通过同源性定向修复实现高效转基因整合
基于核酸酶的基因组编辑的治疗应用将受益于通过同源定向修复 (HDR) 进行转基因整合的改进方法。为了提高 HDR 效率，我们筛选了六种 DNA 依赖性蛋白激酶催化亚基 (DNA-PKcs) 的小分子抑制剂，DNA-PKcs 是替代修复途径非同源末端连接 (NHEJ) 中的关键蛋白，可产生基因组插入/缺失 (INDEL)。从这次筛选中，我们确定 AZD7648 是最有效的化合物。使用 AZD7648 可显著增加 HDR（高达 50 倍）并同时降低各种治疗相关的原代人类细胞类型中不同基因组位点的 INDEL。在所有情况下，HDR 与 INDEL 的比率均显著增加，并且在某些情况下，实现了无 INDEL 的高频 (>50%) 靶向整合。这种方法有可能提高基于细胞的疗法的治疗效果并扩大靶向整合作为研究工具的使用范围。
细菌回试启用人类细胞中的精确基因编辑
重试是参与抗流量防御的细菌遗传元素。它们具有将RNA转录为多拷贝单链DNA（MSDNA）的独特能力，该DNA保持与其模板RNA的共价链接。回合与酵母中的CRISPR-CAS9相结合，已显示可通过同源性定向修复（HDR）提高精确基因组编辑的编辑效率。HDR编辑效率受到与传递编码所需突变的细胞外供体DNA相关的挑战的限制。在这项研究中，我们测试了回发物作为供体DNA产生MSDNA的能力，并通过绑定MSDNA引导HEK293T和K562细胞中的RNA来促进HDR。通过使用CRISPR-CAS9系统的多个细菌物种的反性重构重构，我们证明了HDR速率高达11.3％。总的来说，我们的发现代表了将基于反性的精确基因编辑扩展到人类细胞的第一步。
基因和基因组编辑 - MDC 存储库
通过同源定向修复 (HDR) 定义的 CRISPR-Cas9 基因组编辑对于将点突变和 DNA 供体构建体引入细胞系、动物以及治疗人类遗传疾病非常重要。然而，HDR 修复 DNA 双链断裂 (DSB) 的效率通常远低于非同源末端连接 (NHEJ) 进行的不必要的竞争性修复。因此，找到简单的程序来扭转 CRISPR-Cas9 基因组编辑过程中的 DSB 修复途径选择朝向 HDR 而不降低总基因组编辑效率是非常有意义的 [1] 。基因组编辑效率受 sgRNA/Cas9 的切割效率、参与 DNA 修复的蛋白质的表达以及它们对 DSB 的募集的影响。染色质修饰被认为可以调节所有这些过程。在半定量测定中，未发现 5-氮杂胞苷 (5-aza) 抑制 DNA 甲基化会改变基因组编辑效率 [2] 。组蛋白 3 赖氨酸 36 三甲基化 (H3K36me3) 促进 HDR，而 H3K36me2 以上下文依赖的方式增加 NHEJ [ 3 , 4 ]。据报道，异染色质中的致密 DNA 堆积（以 H3K27me3 和 H3K9me3 为特征）会影响低浓度 CRISPR-Cas9 下的修复速度，但不会影响 HDR/NHEJ 途径选择 [5] 。
基于信息差距决策理论
如今，世界上许多国家正在进行对新能源，尤其是可再生能源的研究，以减少其对传统化石燃料的依赖。 与其他可再生能源相比， 1地热能具有丰富的能量储存，稳定的产量和无化学污染的优势。 然而，由于钻孔，断裂，流动加热和其他技术的局限性，地热功率发生的发展并不明显。 2地热系统的增强发展将加速地热能的提取和利用。 3热岩石（HDR）是一种新型的地热能，可以在皮带中利用，通常在150°C和650°C之间的温度下以低孔隙率和低渗透率存储在3 - 10 km的地下。 4估计中国大陆的HDR资源总量为2.52×1025 J，占标准煤的860×1012 t。 如果根据可回收资源的2％计算，则相当于中国当前年度能源消耗的5300倍。 5因此，HDR的发展和利用在中国早期认识到碳峰和中性的过程中起着至关重要的作用。 6增强的地热系统（EGS）提取物，并通过在HDR中创建人工骨折来利用地热资源。 7目前，对HDR开发的研究重点介绍了热存储挖掘过程和效率评估。 进行检查，Al —Kbodi等。 al -kbodi等。 Zayed等。 10如今，世界上许多国家正在进行对新能源，尤其是可再生能源的研究，以减少其对传统化石燃料的依赖。1地热能具有丰富的能量储存，稳定的产量和无化学污染的优势。然而，由于钻孔，断裂，流动加热和其他技术的局限性，地热功率发生的发展并不明显。2地热系统的增强发展将加速地热能的提取和利用。3热岩石（HDR）是一种新型的地热能，可以在皮带中利用，通常在150°C和650°C之间的温度下以低孔隙率和低渗透率存储在3 - 10 km的地下。4估计中国大陆的HDR资源总量为2.52×1025 J，占标准煤的860×1012 t。如果根据可回收资源的2％计算，则相当于中国当前年度能源消耗的5300倍。5因此，HDR的发展和利用在中国早期认识到碳峰和中性的过程中起着至关重要的作用。6增强的地热系统（EGS）提取物，并通过在HDR中创建人工骨折来利用地热资源。7目前，对HDR开发的研究重点介绍了热存储挖掘过程和效率评估。进行检查，Al —Kbodi等。 al -kbodi等。 Zayed等。 10进行检查，Al —Kbodi等。al -kbodi等。Zayed等。108介绍了具有空心鳍结构的创新的U-管接地热交换器的全面比较数值研究，以增强地面夫妇热泵（GCHP）的性能。9解释了传统的圆形2U管钻孔热交换器（BHES）的开发，该孔（BHES）是一种最佳设计的模型，可最大程度地提高萃取速率并最大程度地降低能量构成特性和BHE数字。
细胞内递送 CRISPR-Cas9 RNP 以用于医疗应用
• 可以进行DNA编辑的工具 • 由Cas9蛋白和gRNA组成 • gRNA识别并切割目标序列。 • 切割的序列主要通过末端连接（NHEJ）或同源重组（HDR）进行修复 • NHEJ容易发生缺失和突变等错误→适用于基因缺失 • HDR可以根据供体DNA的设计引入所需的序列。
文章抑制 SHROOM1 可通过促进同源定向修复来改善体内和体外基因整合
摘要：同源重组 (HR) 常用于实现靶向基因整合，因为与微同源介导的末端连接 (MMEJ) 或非同源末端连接 (NHEJ) 相比，它具有更高的精度和可操作性。由于它只在细胞分裂期间发生，因此似乎对动物细胞和胚胎中的基因整合效率较低。在这里，我们开发了全基因组高通量筛选和随后的配对 crRNA 文库筛选，以寻找抑制同源定向修复 (HDR) 的基因。我们发现，在报告系统中，敲低 SHROOM1 的 HDR 细胞比对照细胞富集多达 4.7 倍。无论供体类型如何，下调 SHROOM1 均可显著促进人类和小鼠细胞中成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/CRISPR 相关蛋白 9 核酸酶 (Cas9) 切割后的基因整合。通过在微注射过程中应用 SHROOM1 siRNA，小鼠胚胎的敲入效率也可以加倍。HEK293T 细胞中 SHROOM1 缺失引起的 HDR 效率增加可被 HDR 抑制剂 YU238259 抵消，但不能被 NHEJ 抑制剂抵消。这些结果表明 SHROOM1 是一个 HDR 抑制基因，SHROOM1 敲低策略可能适用于多种应用，包括基因编辑以生成用于研究基因功能和人类疾病的细胞系和动物模型。