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抗肿瘤坏死因子 (TNF) 等生物制剂治疗克罗恩病 (CD) 安全有效，但患者中原发性和继发性无反应率很高。在本研究中，我们应用计算方法通过计算机模拟发现抗 TNF 难治性 CD 的新型药物疗法。我们使用来自 NCBI GEO 的抗 TNF 难治性 CD 患者的转录组数据集 (GSE100833)。共表达分析后，我们基于蛋白质-蛋白质相互作用数据库 STRING 专门研究了簇中基因间蛋白质-蛋白质相互作用的程度。使用基于 KEGG 基因集的 clEnrich 函数进行通路分析。簇 1、2、3、4 中的共表达基因、上调或下调基因以及所有差异表达基因都高度相关。其中，趋化因子信号传导高度富集的簇 1 也显示出细胞因子-细胞因子受体相互作用的富集，并确定了几种已知对 CD 有效的药物，包括环孢菌素。还确定了伏立诺他、组蛋白去乙酰化酶抑制剂和已知对 NF-κB 活性有抑制作用的荜茇酰胺。一些生物碱也被选为潜在的治疗药物。这些发现表明它们可能成为抗 TNF 难治性 CD 的新型治疗选择，并支持使用公共分子数据和计算方法来发现 CD 的新型治疗选择。
抗肿瘤坏死因子新型候选药物……
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