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RISPR-Cas 系统已被分为六种亚型，在广泛的微生物群落中具有众多直系同源物 1 。最近在未培养微生物中鉴定出的 II 型和 V 型家族的紧凑型 CRISPR 系统，进一步拓宽了我们对不同 CRISPR 机制和传染性病原体之间广泛共同进化的认识 2 – 4 。此外，由于腺相关病毒 (AAV) 的体内递送限制，紧凑型 CRISPR 效应子更适合用于产生基于 CRISPR 的治疗方式，而腺相关病毒通常用于治疗持久性疾病 5 。与 Cas9 和 Cas12 的 DNA 靶向活性相比，Cas13 是最近在 VI 型 CRISPR 系统中鉴定出的具有 RNA 引导的 RNA 干扰活性的单一效应子 6、7。CRISPR-Cas13 为哺乳动物细胞和植物的 RNA 研究提供了多种应用，例如活体成像、RNA 降解、碱基编辑和核酸检测 8 。此前已鉴定出多种 Cas13 效应子，分为四个家族；然而，天然微生物中 CRISPR-Cas13 系统的未知空间仍然难以捉摸。本文，我们在宏基因组数据集中鉴定出两个紧凑的 CRISPR-Cas13 家族，并对其进行改造，使其在哺乳动物细胞中降解 RNA 并进行 RNA 碱基转换。
利用紧凑型 CRISPR–Cas13 系统对未培养微生物进行可编程 RNA 编辑
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