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背景:癌症免疫疗法在过去十年中彻底改变了癌症治疗。然而,大多数患者对免疫疗法没有反应或最终复发,因此有必要确定反应的生物标志物并了解耐药机制。大多数生物标志物研究分析了接受免疫检查点抑制剂 (CPI) 疗法治疗的患者,而肿瘤浸润淋巴细胞过继细胞转移 (TIL-ACT) 的少数研究分析了相对较小的患者队列。方法:为了系统地识别对 TIL-ACT 有反应和有耐药的生物标志物,我们收集了来自四家机构的五种肿瘤类型的 400 名接受 TIL-ACT 治疗的患者的已发表和未发表的肿瘤全外显子组和转录组数据,并使用标准化的生物信息学流程处理这些数据集。结果:为了确定治疗前肿瘤中反应的生物标志物,我们分析了之前报道的生物标志物并在我们的队列中进行生物标志物发现。对于从输注产品和新鲜肿瘤中识别出的 200 名 T 细胞反应性患者子集,我们改进了生物标志物以包括新抗原反应性,并识别了与新抗原反应性相关的突变过程和转录特征。为了确定对 TIL-ACT 获得性耐药的机制,我们分析了 15 名治疗前后成对肿瘤的患者,发现了输注反应性 T 细胞特有的多种免疫逃避机制,包括呈现新抗原的 HLA 等位基因杂合性的缺失、新抗原的基因组缺失和干扰素-γ 信号通路的失活。结论:总之,我们将介绍 TIL-ACT 治疗的生物标志物概况,包括组织学和治疗方式之间的差异,以提高我们对治疗反应机制的理解。

AACR 2024 年年会常规摘要

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