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摘要：由专门的蛋白质形成的突触蛋白– DNA复合物，在DNA上桥接两个或多个远处的位点，与各种遗传过程至关重要。然而，蛋白质搜索这些位点及其如何将它们结合在一起的分子机制尚不清楚。我们以前的研究直接可视化了SIFI使用的搜索途径，并确定了两种途径，DNA螺纹和站点结合的传输途径，这是突触搜索突触DNA-蛋白系统的现场搜索过程的特定。为了研究这些现场搜索途径背后的分子机制，我们将SIFI的复合物与对应于不同瞬态状态相对应的各种DNA底物组装，并使用单分子荧光方法测量了其稳定性。这些组件对应于特定的特定（突触），非特定特异性（非特殊）和特定的特异性（突触前）SIFNA状态。出乎意料的是，发现与特定和非特异性DNA底物组装的突触复合物的稳定性提高。解释这些令人惊讶的观察结果，一种理论方法，描述了这些复合物的组装并将预测与实验进行了比较。该理论通过利用熵参数来解释这种效果，根据该论点，在部分解离之后，非特定的DNA模板具有重新启动的多种可能性，从而有效地提高了稳定性。与特定和非特异性DNA相稳定性的稳定性差异解释了在延时AFM实验中发现的突触蛋白– DNA复合物的搜索过程中螺纹和位点结合的转移途径的利用。
突触蛋白-DNA复合物的组装
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