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摘要：由专门的蛋白质形成的突触蛋白-DNA复合物在DNA上桥接两个或更多远处的蛋白质，与各种遗传过程至关重要。然而，蛋白质搜索这些位点及其如何将它们结合在一起的分子机制尚不清楚。我们以前的研究直接可视化了SFII使用的搜索途径，我们确定了两种途径，即DNA螺纹和站点结合的传输途径，特定于突触DNA-蛋白系统的现场搜索过程。为了研究这些位点搜索途径背后的分子机制，我们将SFII的复合物与与不同瞬态状态相对应的各种DNA底物组装在一起，并使用单分子荧光方法测量了其稳定性。这些组件对应于特定特异性（突触），非特异性非特异性（非特异性）和特定的非特异性（突触前）SFII-DNA状态。出乎意料的是，已经发现了与特异性和非特异性DNA底物组装的突触前复合物的稳定性升高。解释了这些令人惊讶的观察，一种理论方法描述了这些复合物的组装并将预测与实验进行比较。该理论通过利用熵参数来解释这种效果，根据该论点，在部分解离之后，非特异性DNA模板具有重新启动的多种可能性，从而有效地提高了稳定性。与特定和非特异性DNA的SFII复合物的稳定性差异解释了在延时AFM实验中发现的突触蛋白-DNA复合物的搜索过程中螺纹和部位结合的转移途径的利用。
突触蛋白-DNA复合物的组装
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